El origen del nombre de Villarta de San Juan parece deberse a una antigua fortificación de la Orden de San Juan situada en los cercanos Altos de Zambrana, conocida como Villa Harta, es decir, villa cercada, apretada o amurallada. Después varió su denominación jugando con la fonética y la grafía de esas dos palabras, hasta que el Ayuntamiento Constitucional formado tras la Guerra de la Independencia decide fijar el nombre como Villarta de la Orden de San Juan, hasta llegar a nuestros días con la denominación de Villarta de San Juan.
Villarta se localiza en la Llanura Central Manchega, con un término municipal de 66 Km2 y a 626 metros sobre el nivel del mar. El río Gigüela recorre sus tierras en sentido este-oeste, formándose encharcamientos en torno a las vegas de este río cuando las condiciones hídricas lo permiten.
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Villarta de San Juan: